한국어 주어에 붙는 '은/는', '이/가'의 사용이 헷갈리는데요

예를 들어서,

현준이 학교에 갑니다/ 현준이가 학교에 갑니다

현준이 사과를 좋아합니다/현준이는 사과를 좋아합니다

위의 문장 모두 맞죠?

여기서 조사 '이/가' '이/는'이 동시에 사용할 수 있나요?물론 우리가 일상 생활에서 쓰기는 두 번째 문장을 더 많이 쓰고 있는데 초등학교 책에는 첫 문장이 주로 쓰여있더라구요.

두 번 째 문장에서의 '이'는 조사가 아닌가요?

자세한 설명 부탁드려요.